Bandırmaspor’un kuruluşundan önce, Bandırma’da “İdmanyurdu Gençlik” ve “Marmara Gençlik” olmak üzere iki amatör futbol kulübü vardı. 1965 yılında bu iki amatör kulüp birleşme kararı almıştır. 1965-66 sezonu öncesinde “Balıkesir Bandırmaspor”, bordo-beyaz renklerle kurulmuş ve Türkiye 2. Futbol Ligi’ne katılmıştır. 2. Lig’e katılmasıyla, Türkiye profesyonel liglerine katılan ilk ilçe takımı olmuştur.[2]
İlk sezonunda, Kırmızı Grup’u 6. sırada tamamlamıştır. 1966-67 sezonunda Bandırmaspor, Türkiye Kupası’nda yarı finale kadar gelmiş; yarı finalde Altay’a elenmiştir. Ertesi sezon da kupada çeyrek final aşamasına kadar gelen bordo-beyazlılar, Galatasaray’a elenmiştir. 1973-74 sezonunda ligi 15. sırada bitirerek, Türkiye 3. Futbol Ligi’ne düşmüştür. Ertesi sezon, Beyaz Grup’u lider bitirerek yeniden 2. Lig’e yükselmiştir. Uzun süre 2. Lig’de mücadele eden bordo-beyazlı ekip, 1986-87 sezonunda B Grubu’nu sonuncu sırada bitirmiş ve 3. Lig’e düşmüştür. 1988-89 sezonunda grubunu lider bitirerek, 2. Lig’e çıkmıştır. 1992-93 sezonunda, normal sezon sonunda Düşme Grubu’na katılmış ve küme düşmüştür. Uzun bir dönem 3. Lig’de mücadele ettikten sonra, 2004-05 sezonunda grubunu son sırada tamamlayarak Amatör Lig’e düşmüştür.
2008-09 sezonunda, Bandırmaspor yeniden 3. Lig’e yükselmiştir. Ertesi sezon, 3. Lig’de mücadele eden takım, kademe grubunu ezelî rakibi Balıkesirspor’un arkasında, 2. sırada bitirerek Yükselme Grubu’na kalmıştır. Yükselme Grubu’nu 1. sırada bitiren Bandırmaspor, 2. Lig’e yükselmiştir.
Türkiye 2.Lig Beyaz Grup 2017-2018 Sezonu
| Pos | Club | O | G | B | M | A | AV | Puan |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 |  Gümüşhanespor | 33 | 12 | 3 | 2 | 47 | 21 | 64 |
| 2 |  ALTAY | 33 | 10 | 4 | 2 | 43 | 22 | 63 |
| 3 |  SAKARYASPOR A.Ş. | 33 | 9 | 5 | 2 | 30 | 11 | 61 |
| 4 | TEKSÜT BANDIRMA SPOR | 33 | 10 | 1 | 5 | 29 | 9 | 61 |
| 5 |  ASTOR ENERJİ ŞANLIURFASPOR | 33 | 11 | 3 | 3 | 29 | 12 | 60 |
| 6 |  Hacettepe Spor | 33 | 9 | 5 | 3 | 29 | 15 | 56 |
| 7 |  Buğsasspor Aş | 33 | 9 | 4 | 4 | 32 | 12 | 55 |
| 8 |  Konya Anadolu Selçukspor | 33 | 6 | 4 | 5 | 13 | -4 | 52 |
| 9 |  Niğde Anadolu FK | 33 | 8 | 4 | 4 | 14 | 3 | 46 |
| 10 |  Kırklarelispor | 33 | 8 | 3 | 4 | 26 | 4 | 39 |
| 11 |  Kahramanmaraşspor | 33 | 3 | 4 | 9 | 10 | -7 | 39 |
| 12 |  Zonguldak Kömürspor | 33 | 6 | 4 | 4 | 13 | -1 | 38 |
| 13 |  Pendikspor | 33 | 5 | 5 | 6 | 14 | -4 | 36 |
| 14 |  Fatih Karagümrük A.Ş. | 33 | 6 | 2 | 8 | 18 | -6 | 35 |
| 15 |  Fethiyespor | 33 | 3 | 4 | 7 | 15 | -7 | 35 |
| 16 |  Nazilli Belediyespor | 33 | 2 | 3 | 9 | 9 | -21 | 26 |
| 17 |  KARŞIYAKA | 33 | 4 | 5 | 6 | 18 | -6 | 21 |
| 18 |  Silivrispor | 33 | 1 | 3 | 10 | 11 | -17 | 17 |
